Resumo O objetivo deste estudo foi estimar o tamanho na primeira maturidade sexual (Lm) para 36 espécies pertencentes a 24 famílias do hábitat marinho do Baluchistão e Sindh, no Mar Arábico, Paquistão, por meio de modelo empírico e logístico com base no comprimento máximo usando captura comercial, durante junho de 2020 e maio de 2021. O comprimento total individual (TL) foi anotado até 0,1 cm usando medição ampla. O Lm foi calculado por duas fórmulas; (i) log (Lm) = - 0,1246 + 0,9924 * log (Lmax) para elasmobrânquios; e (ii) log (Lm) = - 0,1189 + 0,9157* log (Lmax) para peixes com nadadeiras raiadas. O Lm mínimo foi de 10,27 cm de TL para Caranx malabaricus, e o máximo, de 108,38 cm de TL para Isurus oxyrinchus. Em 58,33% das espécies com Lm foram encontradas faixas de 19,00 cm a 25,00 cm de TL. Este estudo estimou que 16 espécies com Lm estão globalmente ausentes e as 20 espécies restantes com Lm estão ausentes no Mar Arábico (hábitats costeiros do Paquistão). Portanto, os resultados serão úteis para o manejo sustentável e a conservação desses peixes marinhos por meio do estabelecimento da malhagem das redes de arrasto com base no tamanho na primeira maturidade sexual (Lm).

Abstract The aim of this study was to estimate the size at first sexual maturity (Lm) for 36 species belonging to 24 families from the marine habitat of Balochistan and Sindh in Arabian Sea, Pakistan through maximum length based an empirical and logistic model using commercial catch during June 2020 to May 2021. Individual total length (TL) was noted up to 0.1 cm using measuring broad. The Lm was calculated using two formulae; (i) log (Lm) = - 0.1246 + 0.9924 * log (Lmax) for Elasmobranchs and (ii) log (Lm) = -0.1189 + 0.9157* log (Lmax) for ray-finned fishes. The minimum Lm was recorded as 10.27 cm TL for Caranx malabaricus and 108.38 cm TL for Isurus oxyrinchus, respectively. Around Lm with 58.33% species were ranges from 19.00 cm to 25.00 cm TL. This study was estimated 16 newly Lm which is globally absent and rest 20 Lm are absent in the Arabian Sea (Pakistan coastal habitats). Therefore, the results will be helpful for the sustainable management and conservation of these marine fishes through the establishment of mesh size of trawl nets based on the size at sexual maturity (Lm).

Resumo Fatores de transcrição (FT) são uma ampla classe de genes em plantas e podem regular a expressão de outros genes em resposta a vários estresses ambientais (estresses bióticos e abióticos). No presente estudo, a atividade do fator de transcrição na cana-de-açúcar foi examinada durante o estresse pelo frio. Inicialmente, as leituras de transcrição de RNA de duas cultivares de cana-de-açúcar (ROC22 e GT08-1108) sob estresse frio foram baixadas do banco de dados SRA NCBI. As leituras foram alinhadas em um genoma de referência e as análises de expressão diferencial foram realizadas com o pacote R / Bioconductor edgeR. Com base em nossas análises no cultivar ROC22, 963 genes TF foram significativamente regulados positivamente sob estresse pelo frio entre um total de 5.649 genes regulados positivamente, enquanto 293 genes TF foram regulados negativamente entre um total de 3.289 genes regulados negativamente. No cultivar GT08-1108, 974 genes TF foram identificados entre 5.649 genes regulados positivamente e 283 genes TF foram encontrados entre 3.289 genes regulados negativamente. Os fatores de transcrição, em sua maioria, foram anotados com categorias GO relacionadas à ligação de proteína, ligação de fator de transcrição, ligação específica de sequência de DNA, complexo de fator de transcrição, atividade de fator de transcrição em RNA polimerase II, atividade de fator de transcrição de ligação de ácido nucleico, atividade de corepressor de transcrição, sequência específica da região reguladora, atividade do fator de transcrição da RNA polimerase II, atividade do cofator do fator de transcrição, atividade do fator de transcrição do promotor do plastídio, atividade do fator de transcrição do promotor da RNA polimerase I, polimerase II e RNA polimerase III. As descobertas dos resultados acima ajudarão a identificar fatores de transcrição expressos diferencialmente durante o estresse pelo frio. Ele também fornece uma análise abrangente da regulação da atividade de transcrição de muitos genes. Portanto, este estudo fornece base molecular para melhorar a tolerância ao frio em cana-de-açúcar e outras gramíneas economicamente importantes.

Abstract Transcription factors (TF) are a wide class of genes in plants, and these can regulate the expression of other genes in response to various environmental stresses (biotic and abiotic). In the current study, transcription factor activity in sugarcane was examined during cold stress. Initially, RNA transcript reads of two sugarcane cultivars (ROC22 and GT08-1108) under cold stress were downloaded from SRA NCBI database. The reads were aligned into a reference genome and the differential expression analyses were performed with the R/Bioconductor edgeR package. Based on our analyses in the ROC22 cultivar, 963 TF genes were significantly upregulated under cold stress among a total of 5649 upregulated genes, while 293 TF genes were downregulated among a total of 3,289 downregulated genes. In the GT08-1108 cultivar, 974 TF genes were identified among 5,649 upregulated genes and 283 TF genes were found among 3,289 downregulated genes. Most transcription factors were annotated with GO categories related to protein binding, transcription factor binding, DNA-sequence-specific binding, transcription factor complex, transcription factor activity in RNA polymerase II, the activity of nucleic acid binding transcription factor, transcription corepressor activity, sequence-specific regulatory region, the activity of transcription factor of RNA polymerase II, transcription factor cofactor activity, transcription factor activity from plastid promoter, transcription factor activity from RNA polymerase I promoter, polymerase II and RNA polymerase III. The findings of above results will help to identify differentially expressed transcription factors during cold stress. It also provides a comprehensive analysis of the regulation of the transcription activity of many genes. Therefore, this study provides the molecular basis for improving cold tolerance in sugarcane and other economically important grasses.

Resumo O vírus da hepatite C (HCV) é o grave problema de saúde pública das doenças hepáticas. Aproximadamente 170 milhões de pessoas no mundo estão infectadas com HCV; no Paquistão, a doença tem alto índice de ocorrência. O presente estudo prevê uma prevalência atualizada do HCV e distribuição genotípica na população geral do distrito de Mardan, Khyber Pakhtunkhwa (KP), Paquistão. As amostras de sangue de 6.538 indivíduos, incluindo 3.263 homens e 3.275 mulheres, foram analisadas para o antígeno de superfície da hepatite C por teste imunocromatográfico (ICT), ensaio imunoenzimático (ELISA) e reação em cadeia da polimerase de transcrição reversa (PCR). Verificou-se que 396 (12,13%) de 3.263 indivíduos continham anticorpos no sangue contra o HCV, enquanto entre as diferentes faixas etárias as maiores incidências de anticorpos anti-HCV foram encontradas na faixa etária de 31 a 40 anos (11,01%). As amostras positivas para ICT foram posteriormente rastreadas por nested PCR para determinar a existência de HCV-RNA ativo. Identificou-se que 7,11% (3.263) do total da população (6.538) testada foram positivos, dentre os quais 461 (14,07%) mulheres possuíam anticorpos no sangue contra o HCV. Nossos dados mostraram que a infecção total pelo HCV na população investigada foi de 5,78%. Maior porcentagem de prevalência de HCV foi detectada em homens do que em mulheres nas faixas etárias de 31-40 e 41-50. Para comparar a prevalência de genótipos de HCV com relação à idade no genótipo masculino e feminino 3a foi encontrado o genótipo mais prevalente seguido por 1a, 2a e 3b, respectivamente.

Abstract Hepatitis C virus (HCV) is the serious global public health burden of liver disease. Approximately 170 million people in the world are infected with (HCV). In Pakistan, where the disease has high occurrence rate. The present study envisages an up-to-date prevalence of HCV and genotypic distribution in the general population of Mardan District, Khyber Pakhtunkhwa (KP), Pakistan. The blood samples from 6,538 individuals including 3,263 males and 3,275 females were analyzed for hepatitis C surface antigen by Immuno-chromatographic test (ICT), Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), and reverse transcription-polymerase chain reaction (PCR). It was found that 396 (12.13%) out of 3263 individuals contained antibodies in their blood against HCV, while among the different age groups, the highest incidences of HCV antibodies were found in the 31-40 age group (11.01%). The ICT positive samples were further screened by nested PCR to determine the existence of active HCV-RNA. It was identified that 7.11% (3263) of the total population (6538) tested was positive, among which the 461 (14.07%) females possessed antibodies in their blood against HCV. Our data showed total HCV infection in the investigated population was 5.78%. Higher percentage of HCV prevalence was detected in males than females in the age group 31-40 and 41-50. To compare the prevalence of HCV genotypes age-wise in male and female genotype 3a was found most prevalent genotype followed by 1a, 2a and 3b, respectively.

RESUMO Agentes infecciosos causam doenças graves em humanos em todo o mundo, e são responsáveis pelo alto índice de morbimortalidade. A prevalência e a epidemiologia das doenças infecciosas no hospital que atendeu pacientes encaminhados pelos médicos por meio dos achados iniciais e seus fatores de risco associados foram estudadas em Peshawar. Os dados de 174 pacientes infectados foram coletados durante o período de 2015 a 2017 oriundos de dois laboratórios clínicos de Tehsil Matta Swat. O formulário de consentimento informado foi obtido antes da coleta de sangue. Após a obtenção do consentimento informado, foram coletadas amostras de sangue e foi realizado o teste ICT e, em seguida, os casos ICT positivos foram confirmados por PCR. Um total de 174 amostras ICT positivas [106 homens e 68 mulheres] foi incluído neste estudo. A idade considerada foi de 10 a 72 anos. Das 174 tiras de ICT positivas, 99 casos [63 homens, 36 mulheres] foram confirmados por PCR. A taxa de prevalência foi de 56,89%. A injeção IV / IM foi registrada em 100% dos indivíduos. A visita à barbearia foi relatada em (58%) dos indivíduos, os números de casados foram (81,0%), e a operação cirúrgica foi relatada em (44,8%), o compartilhamento de escova de dente foi observado em (29,9%), o piercing foi relatado em (39,7%), antecedentes familiares foram relatados em (26,4%), tratamento odontológico em (21,8%), icterícia (13,2%) e tatuagem em (1,7%). Transfusão de sangue, operações cirúrgicas, icterícia, histórico familiar e tratamento odontológico foram fatores de risco significativos para adquirir infecção por Vírus da Hepatite C (VHC). Concluiu-se que a implementação adequada de medidas de precaução deve ser necessária para controlar a propagação do VHC em um futuro próximo.

ABSTRACT Infectious agents cause serious diseases in humans worldwide and are responsible for the high rate of morbidity and mortality. The prevalence and epidemiology of infectious disease (HCV) in the hospital visited patients referred by the physicians through the initial findings and their associated risk factors were studied in Swat. The data of 174 infected patients were collected during the period of 2015 to 2017 from two clinical laboratories of Tehsil Matta Swat. Inform consent form was taken before blood collection. After taking informed consent blood samples were collected and ICT test was performed and then ICT positive cases were conform through PCR. A total of 174 ICT positive samples [106 male and 68 females] were included in this study. Age was considered from 10 to 72 years. Of the 174 ICT strip positive, 99 [63 males, 36 females] were confirmed through PCR. The prevalence rate was recorded 56.89%. I.V/I.M injection was recorded in 100% of the individuals. Visits to the barber shop was reported in (58%) of the individuals, married individuals were (81.0), surgical operation was reported in (44.8%), sharing toothbrush was observed in (29.9%), piercing was reported in (39.7%), family history was reported in (26.4%), dental treatment was observed in (21.8%), jaundice were (13.2%) and tattooing was (1.7%). Blood transfusion, surgical operations, Jaundice, family history and dental treatment were found significant risk factors for acquiring HCV infection. It was concluded that proper implementation of precautionary measures should be needed to control the spread of HCV in far near future.

Resumo Para o bom crescimento dos peixes, é necessário alimentá-los com uma alimentação adequada e balanceada. Um estudo foi realizado para descobrir o efeito de diferentes dietas à base de proteínas em alevinos de Tor putitora (mahseer). Foi preparado um alimento com níveis de proteína dietética de 35%, 40%, 45% e 50%. O efeito de diferentes alimentos à base de proteína no ganho de peso, taxa de crescimento padrão (SGR), taxa de conversão alimentar (FCR), ganho de peso percentual, eficiência de conversão alimentar (FCE) e taxa de eficiência proteica (PER) foi estudado. Foi observado um aumento na taxa de crescimento com um aumento na concentração de proteína de até 45%. Os alevinos alimentados com dieta de 45% de proteína apresentaram o maior crescimento, seguidos de 50%, 40% e 35%. O valor de SGR foi maior para dieta com 45% de proteína (8,56), seguido de 50% e 40%, enquanto os menores valores foram observados para ração com 35% de proteína (1,57). A mesma tendência foi observada para FCE. Os maiores valores de PER foram observados em peixes alimentados com 45% de ração à base de proteína (0,65), seguido por 50% (0,56), 40% (0,38) e 35% (0,17). A taxa de conversão alimentar foi menor para a dieta com 45% de proteína (3,41), enquanto a maior para a dieta com 35% de proteína (16,85). Concluiu-se que a dieta à base de proteína de 45% foi a melhor formulação alimentar para maior produção de Tor putitora. No entanto, a pesquisa sobre a mesma porcentagem de dieta proteica é recomendada para animais de um ano.

Abstract For the proper growth of fish, it is necessary to feed the fish with a proper and balanced diet. A study was conducted to find out the effect of different protein-based diets on fingerlings of Tor putitora (mahseer). A feed with dietary protein levels of 35%, 40%, 45%, and 50% were prepared. The effect of different protein-based feed on weight gain, standard growth rate (SGR), food conversion ratio (FCR), percent weight gain, food conversion efficiency (FCE), and protein efficiency ratio (PER) was studied. An increase was observed in the growth rate with an increase in protein concentration up to 45%. The fingerlings fed a 45% protein diet shown the highest growth, followed by 50%, 40%, and 35%. The SGR value was greatest for 45% protein diet (8.56) followed by 50% and 40%, while the least values were observed for 35% protein feed (1.57). The same trend was observed for FCE. The highest PER values was observed in fishes fed 45% protein-based feed (0.65) followed by 50% (0.56), 40% (0.38) and35% (0.17). The food conversion ratio was lowest for 45% protein diet (3.41), while the greatest for 35% protein feed (16.85). It was concluded that a 45% protein-based diet was the best feed formulation for higher production of Tor putitora. However, research on the same percentage of protein diet is recommended for yearlings.

Resumo O presente estudo teve como objetivo comparar o tamanho do cérebro de mahseer (Tor putitora) em relação ao seu peso corporal e comprimento padrão, para investigar o impacto potencial do ambiente de criação no desenvolvimento do cérebro em peixes. O peso do cérebro e três de suas subdivisões — cerebelo (CB), tectum óptico (OT) e telencéfalo (TC) — foram medidos para peixes selvagens e criados em incubadoras. Os dados foram analisados usando análise múltipla de covariância (MANCOVA), análise de covariância (ANCOVA) e análise de função discriminante (DFA). Descobrimos que os peixes criados em condições de incubação apresentam menor tamanho do cérebro em relação ao peso corporal quando comparados aos selvagens. Uma diferença significativa (p <0,5) foi observada no comprimento do CB e OT em relação ao comprimento corporal padrão, enquanto nenhuma diferença significativa foi encontrada no CT dos peixes de ambas as origens. Os resultados do estudo atual destacam uma suposição lógica de que a deficiência neural afeta o comportamento dos peixes. É por isso que os peixes criados em cativeiro mostram uma resposta mal adaptativa e enfrentam declínio de aptidão quando liberados no ambiente natural para o aprimoramento do estoque selvagem. O estudo atual concluiu que os peixes criados em incubadoras exibem variações na morfologia cerebral bruta em comparação com suas contrapartes selvagens.

Abstract The present study was aimed at comparing the brain size of mahseer (Tor putitora) in relation to their body weight and standard length, to investigate the potential impact of rearing environment on brain development in fish. The weight of the brain and three of its subdivisions cerebellum (CB), optic tectum (OT), and telencephalon (TC) were measured for both wild and hatchery-reared fish. The data was analysed using multiple analysis of covariance (MANCOVA), analysis of covariance (ANCOVA), and discriminate function analysis (DFA). We found the fish reared under hatchery conditions exhibit smaller brain size related to body weight, when compared to the wild ones. A significant (p<0.5) difference was observed in the length of CB and OT concerning the standard body length while no significant difference was found in TC of the fish from both the origins. The results of the current study highlight a logical assumption that neural deficiency affects the behaviour of fish, that’s why the captive-reared fish show maladaptive response and face fitness decline when released to the natural environment for wild stock enhancement. The current study concluded that hatchery-reared fish exhibit variations in gross brain morphology as compared to their wild counterpart.

Resumo A truta das neves (Schizothorax plagiostomus) é um peixe de água doce economicamente importante, encontrado principalmente nas áreas ao norte de reservatórios de água do Paquistão. O presente estudo foi realizado em River Swat para analisar a bioacumulação de metais pesados (Pb, Cr, Ni e Zn) em tecidos de Schizothorax plagiostomus. Os tecidos foram extraídos e dissolvidos em ácido perclórico (HClO4) e ácido nítrico (HNO3) com placa de aquecimento. Os metais pesados zinco (Zn), chumbo (Pb), cromo (Cr) e níquel (Ni) foram determinados usando espectrofotômetro de absorção atômica Perkin Elmer 2380. Os resultados mostram grande variação no conteúdo do metal relacionado ao tipo de tecido e locais de amostragem. Uma alta concentração de bioacumulação foi relatada em Charbagh, enquanto a mais baixa, em Odigram: Charbagh > Landakai > Odigram. Da mesma forma, Cr foi o metal pesado mais acumulado, seguido por Pb, Ni e Zn.

Abstract Snow trout (Schizothorax plagiostomus) is an economically important freshwater fish, mostly found in northern areas of water reservoirs of Pakistan. The current study was conducted in River Swat to analyze the bioaccumulation of heavy metals (Pb, Cr, Ni, and Zn) in tissues of Schizothorax plagiostomus. Tissues were extracted and dissolved in perchloric acid (HClO4) and nitric acid (HNO3) along with hotplate. The heavy metals, zinc (Zn), lead (Pb), chromium (Cr), and Nickel (Ni) were determined using Perkin Elmer 2380 atomic absorption spectrophotometer. Results shows great variation in the content of the metal related to tissue type and sampling sites. A high concentration of bioaccumulation was reported at Charbagh, whereas lowest at Odigram: Charbagh>Landakai>Odigram. In the same way, Cr was the most accumulated heavy metal followed by lead, nickel, and Zinc:

Resumo A infecção pelo vírus da hepatite B é perigosa entre os cinco tipos de hepatite, pois permanece clinicamente assintomática. O presente estudo traça a prevalência atualizada do vírus da hepatite B (HBV) na população geral de Mardan, Khyber Pakhtunkhwa, no Paquistão. Amostras de sangue de 4.803 indivíduos, incluindo 2.399 homens e 2.404 mulheres, foram investigadas. Todas as amostras suspeitas foram analisadas para o antígeno de superfície da hepatite B usando teste imunocromatográfico (ICT), enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), seguido por transcrição reversa-reação em cadeia da polimerase (RT-PCR). Os resultados mostraram que 312 (13,00%) de 2.399 indivíduos continham anticorpos no sangue contra o VHB, enquanto, entre as diferentes faixas etárias, as maiores incidências de anticorpos VHB foram encontradas nos grupos de 21 a 30 anos (10,73%). Além disso, amostras positivas para ICT foram rastreadas por reação em cadeia da polimerase aninhada para detectar a existência de HBV-DNA ativo. Observou-se que 169 (7,04%) de 2.399 homens do total da população (4803) testados foram positivos. Por outro lado, 463 mulheres (19,25%) possuíam anticorpos no sangue contra VHB. Acumulativamente, nossos resultados mostraram uma porcentagem maior de prevalência de HBV em homens do que em mulheres na faixa etária de 21 a 30 anos. O total de HCV infectados na população geral de Mardan foi registrado em 5,7%, incluindo homens e mulheres.

Abstract Hepatitis B virus infection is perilous among the five types of Hepatitis, as it remains clinically asymptomatic. The present study draws up-to-date prevalence of Hepatitis B virus (HBV) in the general population of Mardan, Khyber Pakhtunkhwa Pakistan. The blood samples from 4803 individuals including 2399 male and 2404 females were investigated. All the suspected samples were analyzed for hepatitis B surface antigen using Immuno-chromatographic test (ICT), Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), and followed by Reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR). Results showed that 312 (13.00%) out of 2399 individuals contained antibodies in their blood against HBV, while among the different age groups, the highest incidences of HBV antibodies were found in the age of 21-30 groups (10.73%). Furthermore, the ICT positive samples were screened by nested polymerase chain reaction to detect the existence of active HBV-DNA. It was observed that 169 (7.04%) out of (2399) male of the total population (4803) tested was positive. On the other hand, the female 463 (19.25%) possessed antibodies in their blood against HBV. Accumulatively, our results showed a higher percentage of HBV prevalence in males than females in the age group 21-30 years. The total HCV infected in Mardan general population was recorded at 5.7% comprising both male and female.

Resumo Três distritos, Lower Dir, Swat e Shangla, em Khyber Pakhtunkhwa, foram pesquisados para a recolha de Pteropus vampyrus (raposa voadora indiana) na divisão de Malakand, região noroeste do Paquistão, de fevereiro a novembro de 2018. Foram capturados 35 espécimes, dos quais 22 foram infectados com ectoparasitas. Três tipos de ectoparasitas foram observados: moscas (20%; n = 7/35), ácaros (28,5%; n = 10/35) e insetos (14,2%; n = 5/35). Os morcegos machos foram mais infectados (57,1%; n = 20/35) do que as fêmeas (42,8%; n = 15/35); porém, nenhuma diferença significativa foi observada (p > 0,05). As moscas foram recuperadas da membrana das asas e da região da cabeça; já os ácaros foram encontrados nas asas, nas orelhas e ao redor dos olhos; por sua vez, os insetos foram encontrados na superfície do corpo e na região do pescoço. O peso corporal, a circunferência e a envergadura dos morcegos machos foram maiores em comparação aos morcegos fêmeas e foram considerados um fator-chave na identificação dos machos e das fêmeas Pteropus vampyrus (raposa voadora indiana). Conclui-se que os Pteropus vampyrus da parte noroeste do Paquistão foram parasitados por uma fauna variada de parasitas com altas taxas de infestação. Assume-se que, em morcegos machos, o número de parasitas é geralmente maior que em fêmeas. Os resultados deste estudo revelaram novos insights sobre a fauna parasita de Pteropus vampyrus.

Abstract Three districts viz. Lower Dir, Swat and Shangla in Khyber Pakhtunkhwa province, were surveyed for the collection of Pteropus vampyrus (the Indian flying fox) in Malakand division, the north western region of Pakistan from February to November 2018. A total of 35 specimens were captured. Out of the examined specimens 22 were found to be infected with ectoparasites. Three types of ectoparasites were observed including flies 20% (n=7/35), mites 28.5% (n=10/35) and bugs 14.2% (n=5/35). Male bats were more infected 57.1% (n=20/35) as compared to females 42.8% (n=15/35), however, no significant difference (p>0.05) was noted. Flies were recovered from wings membrane and head region, mites were found on wings, ears and around eyes while bugs were found attached on body surface and neck region. Body weight, circumference and wing span of male bats were greater as compared to female bats and were considered a key factor in clear cut identification of male and female Pteropus vampyrus (the Indian flyingfox). It was concluded that Pteropus vampyrus from north western part of Pakistan were parasitized by a varied parasite fauna with high infestation rates. We assume that in male bats the number of parasites is generally higher than in females. Our results revealed new insights into parasite fauna of Pteropus vampyrus.